(1) 大多数水性聚氨酯黏合剂中不含-NCO基团，因而主要靠分子内极性基团产生内聚力和黏附力进行固化。而溶剂型或无溶剂型单组分及双组分聚氨酯黏合剂可充分利用-NCO基团的反应，在黏结固化过程中增强黏结性能。水性聚氨酯中含有羧基、羟基等基团，在适宜条件下可参与反应，使黏合剂产生交联。
(2) 相同的固体含量，水性黏合剂的黏度较溶剂型黏合剂要小。水性聚氨酯的黏度一般通过水溶性增稠剂和水来调整。而溶剂型黏合剂的黏度可通过提高固含量、聚氨酯的分子量或选择适宜的溶剂来调整。
(3) 由于水的挥发性比有机溶剂差，故水性聚氨酯黏合剂的干燥速度较慢，并且水的表面张力大，对表面疏水性基材的润湿能力较差。当大部分水分未从黏结层挥发到空气中时，不易得到连续性的胶层。由于大多数水性聚氨酯黏合剂是以亲水性的聚氨酯为主要固体成分，胶膜干燥后若未形成一定程度的交联，则耐水性不佳。
(4) 水性聚氨酯黏合剂可与多种水性树脂混合，以改进性能或降低成本。此时应注意离子型水性黏合剂的离子性质和酸碱性，否则可能引起凝聚。因受到聚合物间的相容性或在某些溶剂中的溶解性的影响，溶剂型聚氨酯黏合剂只能与为数有限的其他树脂黏合剂共混。
(5) 水性聚氨酯黏合剂气味小，操作方便，残胶易清理，而溶剂型聚氨酯黏合剂使用中有时还需耗用大量溶剂，清理也不及水性黏合剂方便。
(6) 水性聚氨酯黏合剂具有材料适应范围广的特点，可以与目前软包装常用的材料形成很好的黏结性能，这是优于水性丙稀酸黏合剂的特性，但成本要高。
(7) 水性聚氨酯黏合剂解决了困扰水性丙烯酸黏合剂冬季储运的难题。